典型文献
栽培丹参居群外转录间隔区(ETS)遗传多样性分析
文献摘要：
为了解栽培丹参居群核糖体RNA基因外转录间隔区(ETS)的遗传多样性及其系统发育关系,该研究以征集到的国内40份栽培丹参居群为材料,采用PCR首次成功扩增了栽培丹参居群的ETS序列,利用生物信息学手段对其序列进行了分析比较.结果表明:40个栽培丹参居群的ETS序列长度为421～433 bp,其中32个栽培丹参居群ETS序列长度为422 bp;GC含量为56.8％～62.8％,向GC方向偏斜;共有241个单核苷酸多态性(SNP)变异位点,变异率高达54.8％,有205个简约信息位点;基于ETS序列的SNP指纹可以鉴定14个栽培丹参居群.贝叶斯分析表明:其最佳核苷酸替代模型为HKY+I.对ETS序列的遗传多样性分析表明:栽培丹参在物种水平上存在非常丰富的遗传多样性.中性检验显示其在p>0.10的水平差异不具有统计学意义,符合中性进化模型.基于ETS序列的系统进化树表明:40个栽培丹参居群聚类在2个系支上,其中最大似然法(ML)和邻近连接法(NJ)聚类结果一致,较最大简约法更适合丹参ETS聚类分析.
文献关键词：
丹参;栽培居群;外转录间隔区;遗传多样性;系统发育关系
中图分类号：
作者姓名：
冯洁;尹艳艳;廖芳;孔德英;马浩予;唐嘉浩;李关荣
作者机构：
西南大学农学与生物科技学院,重庆 400716;天津海关动植物与食品检测中心,天津 300461;重庆海关技术中心,重庆 401333
文献出处：
引用格式：
[1]冯洁;尹艳艳;廖芳;孔德英;马浩予;唐嘉浩;李关荣-.栽培丹参居群外转录间隔区(ETS)遗传多样性分析)[J].西南大学学报（自然科学版）,2022(12):29-38
A类：
外转录间隔区,HKY+I
B类：
丹参,ETS,遗传多样性分析,核糖体,系统发育关系,征集,利用生物,bp,偏斜,单核苷酸多态性,SNP,变异位点,简约,指纹,贝叶斯分析,替代模型,非常丰富,中性检验,系统进化树,群聚,最大似然法,ML,接法,NJ,约法,栽培居群
AB值：
0.233026
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