典型文献
基于生物信息学筛选女性肺腺癌核心基因及其特征分析
文献摘要：
目的:利用生物信息学方法对女性肺腺癌肿瘤组织及正常组织的差异表达基因进行筛选及分析,筛选出女性肺腺癌发生发展的关键基因,并为后续研究提供候选基因.方法:从GEO数据库中下载肺腺癌基因芯片数据集 GSE19804、GSE40791、GSE31210、GSE7670、GSE10072、GSE32863、GSE75037,利用在线工具GEO2R筛选出数据集中正常女性肺组织和女性肺腺癌组织的差异表达基因(DEGs),然后利用DAVID数据库对DEGs进行GO和KEGG富集分析,接着利用STRING和Cytoscape软件构建蛋白互相网络(PPI)并筛选出Hub基因,并利用oncomine、U ALCAN数据库进行验证,最后使用Kaplan-Meier plotter数据库对筛选出的Hub基因进行生存分析.结果:在7个数据集中共筛选出276个DEGs,其中69个上调,207个下调.共筛选出CDC20、CENPF、KIAA0101、TOP2A、ASPM、TYMS、MCM4、NUSAP1、MELK、UBE2C 等 10 个 Hub 基因,Kaplan-Meier 生存分析显示除ASPM外,其余9个均与女性肺腺癌的总体生存率相关.结论:最终筛选出的10个Hub基因可能与女性肺腺癌的发生发展密切相关,其可能是女性肺腺癌发病机制、预后判断和治疗研究的新靶点.
文献关键词：
肺腺癌;女性;生物信息学;GEO数据库;差异表达基因
中图分类号：
作者姓名：
李琦;王梅芳;唐以军
作者机构：
十堰市太和医院(湖北医药学院附属医院)呼吸与危重症医学科 湖北 十堰 442000
文献出处：
引用格式：
[1]李琦;王梅芳;唐以军-.基于生物信息学筛选女性肺腺癌核心基因及其特征分析)[J].武汉大学学报（医学版）,2022(03):427-433
A类：
GSE19804,GSE40791,GSE7670,GSE10072,oncomine,ALCAN,KIAA0101
B类：
肺腺癌,核心基因,利用生物,生物信息学方法,癌肿,肿瘤组织,正常组织,差异表达基因,关键基因,候选基因,下载,癌基因,基因芯片,GSE31210,GSE32863,GSE75037,GEO2R,中正,肺组织,癌组织,DEGs,DAVID,富集分析,STRING,Cytoscape,软件构建,PPI,Hub,Kaplan,Meier,plotter,生存分析,CDC20,CENPF,TOP2A,ASPM,TYMS,MCM4,NUSAP1,MELK,UBE2C,总体生存率,率相关,预后判断,治疗研究,新靶点
AB值：
0.396115
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
