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典型文献
应用CRISPR/Cas9介导的基因编辑系统研究B细胞中转录因子T-bet的调控作用
文献摘要:
目的·通过优化后的CRISPR/Cas9基因编辑系统,研究原代B细胞中转录因子T-bet对抗体类别转换的调控作用.方法·系统性分析GEO公共数据库中体外诱导分化的B细胞转录组测序结果,探索转录因子T-bet对抗体类别转换的调控.构建靶向基因为Tbx21(T-box 21,编码T-bet)的小向导RNA(small guide RNA,sgRNA)反转录病毒表达载体,使用Plat-E细胞系作为病毒包装细胞系获得装有sg-Tbx21质粒的反转录病毒并对其浓缩.使用B细胞受体抗体、抗CD40抗体和Toll样受体激动剂体外协同刺激Cas9转基因小鼠的脾脏B细胞,感染高滴度反转录病毒颗粒实现基因编辑.流式细胞术分选感染细胞,提取基因组DNA进行PCR扩增后对靶向序列进行测序,利用ICE CRISPR分析工具计算基因敲除效率.体外诱导B细胞分化为浆细胞,采用ELISA检测基因编辑后B细胞培养上清液中IgM、IgG2c、IgG3抗体类别的丰度,通过独立样本t检验比较sg-NC组与sg-Tbx21组细胞上清液中抗体水平的差异.结果·①经分析GEO数据库发现,γ干扰素可以诱导B细胞中Tbx21基因的表达,且在T-bet的转录调控下,B细胞展现抗体类别转换相关通路活化的转录组特征.②使用浓缩后的高滴度病毒感染激活的B细胞,可以构建高效的反转录病毒感染原代B细胞体系.③Cas9转基因小鼠原代B细胞转染sg-Tbx21质粒后成功实现Tbx21基因敲除,敲除效率约为59%.④在体外诱导B细胞分化为浆细胞的条件下,sg-Tbx21转染后的B细胞培养上清液中IgG2c水平显著降低(P=0.000),IgM和IgG3的水平无明显的变化.结论·通过浓缩反转录病毒和协同刺激激活原代B细胞的方式可提高sgRNA递送的效率,在Cas9转基因小鼠原代B细胞中敲除Tbx21基因;应用这一系统证明了T-bet敲除后阻碍了IgG2c抗体类别的产生.
文献关键词:
小向导RNA;反转录病毒;B细胞;基因编辑;T-bet;抗体类别转换
作者姓名:
韩夏夏;顾霜霜;戴黛;沈南
作者机构:
上海交通大学医学院附属仁济医院风湿科,上海风湿病学研究所,上海 200127
引用格式:
[1]韩夏夏;顾霜霜;戴黛;沈南-.应用CRISPR/Cas9介导的基因编辑系统研究B细胞中转录因子T-bet的调控作用)[J].上海交通大学学报(医学版),2022(04):433-442
A类:
IgG2c
B类:
CRISPR,Cas9,基因编辑,bet,原代,抗体类别转换,系统性分析,GEO,公共数据库,体外诱导分化,转录组测序,Tbx21,box,向导,small,guide,sgRNA,反转录病毒,病毒表达载体,Plat,细胞系,病毒包装,装有,质粒,细胞受体,CD40,Toll,样受体,受体激动剂,外协,转基因小鼠,脾脏,滴度,病毒颗,流式细胞术,分选,对靶,ICE,基因敲除,除效率,细胞分化,浆细胞,细胞培养,养上,上清液,IgM,IgG3,NC,抗体水平,干扰素,转录调控,换相,相关通路,转录组特征,细胞体,细胞转染,过浓,递送
AB值:
0.254412
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