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3对不同抑郁表型青少年同卵双生子的差异甲基化研究
文献摘要：
目的 对同卵不同抑郁表型双生子外周血DNA甲基化差异进行筛查,探讨差异基因是否可作为参与抑郁发生的候选基因.方法 募集在校青少年双生子并进行卵形鉴定.以贝克抑郁量表第2版(Beck Depression Inventory-Ⅱ,BDI-Ⅱ)、长处与困难问卷(Strengths and Difficulties Questionnaire,SDQ)学生版本的情绪因子得分确定双生子个体间的抑郁表型差异.850k甲基化测序后选取P＜0.05、且甲基化β值差值绝对值大于0.1(| Aβ| ＞0.1)为差异甲基化位点.进行基因本体论(GO)功能注释分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,以及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,以识别与抑郁症(major depressive disorder,MDD)相关的重要基因及其甲基化水平改变.结果 纳入同卵不同抑郁表型青少年双生子3对,分为抑郁表型组和正常表型组,两组间共筛选出57个有甲基化水平差异基因,其中45个基因DNA甲基化水平升高,12个基因DNA甲基化水平降低.GO分析显示差异基因在中枢神经系统发育、RNA代谢过程调控等生物学过程富集显著,KEGG分析发现其在突触长时程抑制(LTD)、PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路有明显富集.而在PPI网络中发现RHOA与多个差异甲基化基因存在直接或间接相互作用.结论 在同卵不同抑郁表型双生子外周血中存在CSF1R、NOS1、AHR等基因的DNA甲基化水平改变,可能调节基因表达并通过LTD、PI3K-Akt等信号通路参与抑郁发生.
文献关键词：
DNA甲基化;抑郁;双生子;青少年
中图分类号：
作者姓名：
易立;侯枭;杨舒;赵连生;陈晓鹭;邓伟;陈界衡;唐伟杰;张书弟;傅一笑
作者机构：
400016重庆,重庆医科大学附属第一医院精神科;401331重庆,重庆医药高等专科学校临床医学院;610041成都,四川大学华西医院精神医学研究室,心理卫生中心;310000杭州,杭州市第七人民医院物理诊疗中心
文献出处：
引用格式：
[1]易立;侯枭;杨舒;赵连生;陈晓鹭;邓伟;陈界衡;唐伟杰;张书弟;傅一笑-.3对不同抑郁表型青少年同卵双生子的差异甲基化研究)[J].陆军军医大学学报,2022(04):302-309
A类：
850k,NOS1
B类：
同卵双生子,差异基因,候选基因,募集,卵形,贝克抑郁量表,Beck,Depression,Inventory,BDI,长处与困难问卷,Strengths,Difficulties,Questionnaire,SDQ,表型差异,甲基化测序,甲基化位点,基因本体论,功能注释,京都基因和基因组百科全书,通路富集分析,蛋白质相互作用,PPI,抑郁症,major,depressive,disorder,MDD,甲基化水平,表型组,平降,中枢神经系统,神经系统发育,代谢过程,过程调控,生物学过程,突触,长时程,LTD,PI3K,Akt,显富,RHOA,差异甲基化基因,间接相互作用,CSF1R,AHR
AB值：
0.318376
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