典型文献
辣椒中LACS家族基因鉴定及其对非生物胁迫的响应
文献摘要:
为探究LACSs基因家族成员特征及其在辣椒非生物胁迫中的调控功能,通过同源性搜索,共鉴定出10个LACSs家族基因.然后通过生物信息学手段分析研究了其基因结构、基因组定位、系统发育关系和基因表达.根据系统发育分析可将鉴定到的10个LACSs基因分为8个亚家族,其中7个基因不均匀分布在辣椒染色体上,还有3个未被标定在染色体上.启动子顺式元件分析结果表明,CaLACSs可能参与了植物激素和/或非生物胁迫反应的调控.此外,辣椒材料'6421'的表达谱分析表明,CaLACS基因在不同组织和逆境胁迫下存在明显的差异表达,说明CaLACS基因具有组织特异性,在抗低温、高温以及盐胁迫过程中CaLACS基因发挥重要作用.耐盐品种'H1023,与盐敏感品种'XWHJ-M,的qRT-PCR结果表明,CaLACS1和CaLACS2显著受盐胁迫诱导表达,耐盐品种比盐敏感品种的表达量更高,其可能在响应NaCl胁迫中起到关键性作用.总的来看,LACSs基因家族成员可能在响应生物和非生物胁迫中发挥重要作用.
文献关键词:
辣椒(Capsicum annuum L.);LACS家族;非生物胁迫;基因表达;生物信息学
中图分类号:
作者姓名:
贾切;刘亚博;王飞;姚明华;余楚英;沈胜;刘奕清;李宁
作者机构:
长江大学园艺园林学院,长江大学香辛作物研究院,湖北荆州434025;蔬菜种质创新与遗传改良湖北省重点实验室,湖北省农业科学院经济作物研究所,湖北武汉430064;海南大学园艺学院,海南 海口 570228
文献出处:
引用格式:
[1]贾切;刘亚博;王飞;姚明华;余楚英;沈胜;刘奕清;李宁-.辣椒中LACS家族基因鉴定及其对非生物胁迫的响应)[J].长江大学学报(自科版),2022(06):117-126
A类:
LACSs,CaLACSs,CaLACS,H1023,XWHJ,CaLACS1,CaLACS2
B类:
辣椒,家族基因,基因鉴定,非生物胁迫,基因家族,调控功能,同源性,基因结构,系统发育关系,系统发育分析,亚家族,不均匀分布,启动子,顺式,植物激素,或非,胁迫反应,表达谱分析,不同组织,逆境胁迫,下存,差异表达,有组织,组织特异性,抗低温,盐胁迫,耐盐品种,盐敏感,敏感品种,qRT,诱导表达,NaCl,总的来看,Capsicum,annuum
AB值:
0.274548
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