典型文献
基于虚拟筛选与分子动力学模拟探究轮状病毒抑制剂研发
文献摘要:
目的:探究人优势轮状病毒毒株(Rotaviruses,RVs)VP8*是否存在与脂肪酸保守性结合的位点,从中筛选出与VP8*靶点特异性结合的分子.方法:应用分子对接的方法,搜寻VP8*与脂肪酸分子结合的可能位点,并利用虚拟筛选从包含7655个化合物的数据库中针对潜在位点进行对接,然后对得分高的蛋白配体复合物进行分子动力学(MD)模拟.结果:分子对接发现脂肪酸酸结合于VP8表面的似峡谷的口袋,脂肪酸与预测的口袋之间形成了较强的相互作用;虚拟筛选打分与MD模拟的参数证实了Doxorubicin-Semiquinone、ZINC000004216238VP8结合的稳定性.结论:人优势流行株轮状病毒蛋白VP8*与脂肪酸分子结合具有保守性,Doxorubicin-Semiquinone、ZINC000004216238可以作为人轮状病毒的潜在抑制剂的分子骨架.
文献关键词:
轮状病毒;VP8*;分子对接;虚拟筛选
中图分类号:
作者姓名:
梁中;曾理;余星
作者机构:
湖南师范大学医学院,长沙 410013
文献出处:
引用格式:
[1]梁中;曾理;余星-.基于虚拟筛选与分子动力学模拟探究轮状病毒抑制剂研发)[J].湖南师范大学学报(医学版),2022(01):1-3
A类:
Rotaviruses,RVs,VP8,Semiquinone,ZINC000004216238VP8,ZINC000004216238
B类:
虚拟筛选,分子动力学模拟,轮状病毒,病毒抑制,病毒毒株,保守性,特异性结合,分子对接,搜寻,分子结,个化,在位,复合物,MD,接发,酸酸,峡谷,口袋,打分,Doxorubicin,优势流,病毒蛋白
AB值:
0.22424
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