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基于生物信息学分析肝内胆管细胞癌与肝细胞癌基因表达和分子机制差异
文献摘要：
目的 探讨肝内胆管细胞癌(ICC)和肝细胞癌(HCC)的基因表达及分子机制差异.方法 从基因表达数据库下载ICC和HCC基因表达矩阵,通过基因集富集分析探讨ICC与正常组织、ICC与HCC的差异,获得共激活和共抑制的特征基因集.提取核心基因,使用MCODE分析关键分子模块,通过基因本体和京都基因与基因百科全书(KEGG)分析关键分子模块中的基因潜在的生物学过程和信号通路,并基于细胞水平利用聚合酶链反应阵列评估上述基因的相对表达水平.结果 与HCC相比,ICC中激活的基因集主要体现在上皮间质转化、细胞周期及p53相关的基因集,而物质代谢相关的基因集则被明显抑制.共激活特征基因集中获得2个关键分子模块,其生物学过程和KEGG信号通路主要富集在细胞周期及细胞外基质相关的信号通路;共抑制基因集中获得3个关键分子模块,其生物学过程和KEGG信号通路主要富集在物质代谢的相关通路.聚合酶链反应阵列分析结果显示细胞周期相关基因在ICC、HCC中均高水平表达,ICC中与细胞外基质相关的胶原蛋白家族基因也呈现明显的高水平表达,而物质代谢相关的基因则被明显抑制.结论 物质代谢和细胞周期的调控异常可能是ICC致病的重要环节,也是有别于HCC致病的关键所在,为从物质代谢和细胞周期角度挖掘ICC有价值的诊断和治疗的潜在分子靶点提供了参考.
文献关键词：
肝内胆管细胞癌;肝细胞癌;生物信息学分析;基因富集分析
中图分类号：
作者姓名：
杜志兴;宋天亮;魏孔孔;魏育才;王纪泽;周辉年
作者机构：
兰州大学第二医院肿瘤中心肿瘤外科,甘肃兰州730030;兰州大学第二医院普通外科一病区,甘肃兰州730030
文献出处：
引用格式：
[1]杜志兴;宋天亮;魏孔孔;魏育才;王纪泽;周辉年-.基于生物信息学分析肝内胆管细胞癌与肝细胞癌基因表达和分子机制差异)[J].兰州大学学报（医学版）,2022(07):22-29
A类：
B类：
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AB值：
0.229223
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