典型文献
牙周重建生物功能与调节通路关键基因的筛选
文献摘要：
背景:在牙周重建组织工程学中,包含基因众多且无法通过生物实验逐一验证.借助生物信息学手段,整合分析相关基因,构建牙周重建相关的级联调控通路,从而找到开启牙周重建的关键基因.目的:文章以分析牙周重建生物过程和调节机制为着眼点,旨在筛选出牙周重建过程中关键性的启动基因,为牙周重建治疗寻找理想的基因靶点.方法:①采用GO功能注释体系,对参与牙周重建的干细胞分化、骨组织改建以及牙周软组织形成功能的基因做整合分析,找出各功能交集基因;②集成TRANSFAC、TarBase、TransmiR、miRTarBase及miRecords数据库,建立"牙周重建相关的级联调控通路",将牙周重建生物学过程内的所有基因映射到调控网络内,用广度优先算法将这一子网内的所有线性通路挖掘出来,找出调控上游基因.结果 与结论:①干细胞分化、成骨细胞分化/成骨细胞增殖以及成纤维细胞增殖3种生物功能的交集基因是CDK6和SFRP1;②级联调控通路中,可以作为上游调控牙周重建的关键基因有3个一级基因:骨形态发生蛋白7、PAX2和SMAD3,有2个二级基因:RUNX2和JUN,有2个3级基因:ESR1和GNAS;上游起始基因多包含在成骨细胞分化/成骨细胞增殖功能过程中;③结果证实:SFRP1,骨形态发生蛋白7,PAX2,SMAD3,RUNX2,JUN,ESR1,GNAS基因在牙周重建过程中起关键作用.牙周重建过程极有可能开始于骨组织改建,包括成骨细胞分化和成骨细胞增殖,接下来是成纤维细胞增殖.
文献关键词：
干细胞;成骨细胞;细胞增殖;牙周重建;生物信息学;生物功能;调节通路;基因
中图分类号：
作者姓名：
冯冬菲;何洪旭;谢琪;张立立;周惠;李威
作者机构：
哈尔滨市儿童医院,黑龙江省哈尔滨市150010;哈尔滨市口腔医院,黑龙江省哈尔滨市150016
文献出处：
引用格式：
[1]冯冬菲;何洪旭;谢琪;张立立;周惠;李威-.牙周重建生物功能与调节通路关键基因的筛选)[J].中国组织工程研究,2022(02):253-259
A类：
牙周重建
B类：
生物功能,调节通路,关键基因,组织工程学,生物实验,整合分析,联调,调控通路,生物过程,调节机制,为着,着眼点,重建治疗,基因靶点,功能注释,骨组织,组织改建,软组织,组织形成,交集,TRANSFAC,TransmiR,miRTarBase,miRecords,生物学过程,射到,调控网络,广度优先算法,一子,子网,网内,有线,挖掘出,掘出来,出调,成骨细胞分化,成骨细胞增殖,成纤维细胞增殖,CDK6,SFRP1,骨形态发生蛋白,PAX2,SMAD3,RUNX2,JUN,ESR1,GNAS,始基,程极,能开,接下来
AB值：
0.265515
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