典型文献
基于ACNN-BLSTM的环状RNA识别
文献摘要：
环状RNA（circRNA）是一类新的内源性非编码RNA，广泛存在于真核转录组中，它的环状结构是在剪接过程中通过5'端和3'端共价键反向连接形成.在过去的20多年里，环状RNA可以作为miRNA海绵发挥作用并且在基因调控中，环状RNA与癌症也有密切关系.所以，检测环状RNA对于理解它们的生物作用和生物起源是非常重要的.目前检测环状RNA的一般方法是依赖高通量测序（RNA-Seq），通过在数据中检测RNA的反向剪接位点.然而，由于数据本身和识别的准确度不高，导致其结果假阳性和假阴性偏高.因此，找到一种更准确、更快速的方法识别环状RNA是非常有必要的.为此，提出了基于深度学习的环状RNA识别方法，使用非对称卷积神经网络（ACNN）加双向长短时记忆网络（Bi-LSTM）的架构，利用环状RNA自身的序列特征在长非编码（lncRNA）中进行识别.实验结果表明：所提出的ACNN-BLSTM模型，在各方面性能指标和识别准确率上，都为5种模型中最优，并且识别准确率也达到了90%以上，对比另外四种常见的单一神经网络模型，该方法具有一定的优势.
文献关键词：
环状RNA;非对称卷积神经网络;双向长短时记忆网络;RNA识别
中图分类号：
作者姓名：
程威;王帅;范锦江;彭景;林显光;陈恒玲
作者机构：
中南民族大学 生物医学工程学院,武汉 430074
文献出处：
引用格式：
[1]程威;王帅;范锦江;彭景;林显光;陈恒玲-.基于ACNN-BLSTM的环状RNA识别)[J].中南民族大学学报（自然科学版）,2022(06):697-705
A类：
B类：
ACNN,BLSTM,circRNA,内源性,转录组,环状结构,接过,共价键,miRNA,基因调控,密切关系,一般方法,Seq,反向剪接,假阳性,假阴性,方法识别,非对称卷积神经网络,双向长短时记忆网络,Bi,序列特征,长非编码,lncRNA,识别准确率
AB值：
0.256859
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
