典型文献
基于比较转录组学的多花黄精黄酮类化合物合成基因表达分析
文献摘要：
为了解药用植物多花黄精Polygonatum cyrtonema Hua.中黄酮类化合物的生物合成途径,为黄精属植物黄酮类化合物的代谢与调控的分子机制研究提供数据,利用二代高通量测序技术,对分别培养了 3个月和9个月的多花黄精组培苗根茎进行比较转录组学研究.结果显示,经序列组装与功能注释,多花黄精根茎的转录组数据经拼接共产生了 73 218条unigenes序列,其中35 511条被注释;共鉴定出83条unigenes序列,分别编码18个参与黄酮类化合物合成的关键酶;在幼苗期根茎中表达的1 359个转录因子中,以bHLH最为丰富,其次是ERF、MYB-relaed、C2H2和NAC.FPKM表达分析显示,随着多花黄精块茎中黄酮类化合物的不断积累,18个酶基因中的9个显著上调,3个显著下调,6个无明显表达差异.RT-qPCR分析进一步验证了转录组FPKM结果的可靠性.本研究为解析黄精属植物黄酮类化合物的合成与积累机制提供了参考.
文献关键词：
多花黄精;转录组;黄酮类化合物;生物合成
中图分类号：
作者姓名：
叶碧欢;杨阳;朱杰丽;石从广;陈友吾;胡传久;宋其岩;李海波
作者机构：
浙江省林业科学研究院,浙江杭州310023;浙江农林大学林业与生物技术学院,浙江杭州311300
文献出处：
引用格式：
[1]叶碧欢;杨阳;朱杰丽;石从广;陈友吾;胡传久;宋其岩;李海波-.基于比较转录组学的多花黄精黄酮类化合物合成基因表达分析)[J].食品与生物技术学报,2022(04):84-92
A类：
relaed
B类：
比较转录组,转录组学,多花黄精,黄酮类化合物,基因表达分析,解药,药用植物,Polygonatum,cyrtonema,Hua,中黄,生物合成途径,黄精属,植物黄酮,二代高通量测序,高通量测序技术,组培苗,根茎,组学研究,功能注释,转录组数据,拼接,unigenes,分别编,关键酶,幼苗期,bHLH,ERF,MYB,C2H2,NAC,FPKM,块茎,酶基因,表达差异,qPCR,积累机制
AB值：
0.287151
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